emathAe.sty で，解答部を巻末に集めたいときは
小問1の解答冒頭に \item のオプションを記述します。

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\documentclass[a4j,fleqn]{jarticle}
\usepackage{emath}
\usepackage{emathAe}
\usepackage{showexample}

\begin{document}
  \enumLmargin{0pt}
  \openKaiFile
  \begin{enumerate}[\protect\expandafter\fbox1]
    \item 大問1 \kaitou{\setKaienum{edaenumerate}}%
      \begin{enumerate}[(1)]
        \item 小問1
          \begin{Kaitou}
            <edaitemindent=2zw>
            解答1
          \end{Kaitou}
        \item 小問2 \begin{Kaitou} 解答2 \end{Kaitou}
        \item 小問3 \begin{Kaitou} 解答3 \end{Kaitou}
        \item 小問4 \begin{Kaitou} 解答4 \end{Kaitou}
      \end{enumerate}
  \end{enumerate}
  \closeKaiFile
  \hrule
  【解答】

  \inputKaiFile
\end{document}

▼関連発言
│
└◆3216:\item 直後の edaenumerate [tDB] 06/10 16:17
　└◆3217:Re:emathAe の場合 [tDB] 06/10 17:30
　　└◆3223:Re[2]:emathAe の場合（その２） [tDB] 06/11 14:01<-last