自己レスです．
解決しました．

\documentclass{jarticle}
\usepackage{emathEy}

\begin{document}
\begin{enumerate}
\item あ\hfill(5点)
\item い\hfill(4点)\par
        \begin{edaenumerate}
        \item イ
        \item ロ
        \end{edaenumerate}
\end{enumerate}
\end{document}

で，ずれなくなりました(改行(\\)では動作が異なります??)．
\def\Haiten#1{\hspace*{\fill}(#1点)\par\mbox{}}
のように定義を書き換えるだけで済みますので，
さしあたり私にとっては問題がなくなりました．
お騒がせしました．

▼関連発言
│
└◆6022:emathEy の所為かどうか分からないのですが． [Quasi] 05/16 16:36
　└◆6023:Re:emathEy の所為かどうか分からないのですが． [Quasi] 05/16 16:52<-last