> 　書き込んでいただいたファイル、タイプセットしてみました。
> すると、6475-1.texでは普通に出力できましたが、
> 6475-2.texでは、以下のようなエラー表示がでて出力できませんでした。
> 
> 6475-2.tex(7): エラー: ! Undefined control sequence.
> 6475-2.tex(8): エラー: ! Undefined control sequence.

No.6479 で
>> そのログを貼り付けていただければ、お力になれるかもしれません。
は ログファイル とするべきでした。
今後
Undefined control sequence.
が出るような場合は
その前後も提示していただけるとありがたいです。

確認ですが
\begin{enumerate} でなく
\begin{enumerate}[(1)]
という記述は
プリアンブル部に
拡張された enumerate 環境を必要としていることを
お気づきでしょうか

原因は No.6481 で述べられているようですし
tommy_minor さんは ceo.sty 群について
経験も後豊富なようなので
そちらのアドバイスにが参考になりそうです。 
# No.6482 なども目を通されてはいかがでしょう。

> 　\emathのインストールが大失敗したのかもしれませんね。。
ceo.sty の絡んでいないソースで
タイプセットでエラーが出るのは重傷だと思います。
問題を切り分けて対処なさってはいかがでしょう。

▼関連発言
│
└◆6475:enumerate環境が使えなくなりました [さとう] 09/23 23:42
　└◆6476:Re:enumerate環境が使えなくなりました [TS] 09/23 23:51
　　└◆6477:Re[2]:enumerate環境が使えなくなりました [さとう] 09/24 00:26
　　　├◆6478:Re[3]:enumerate環境が使えなくなりました [名無し] 09/24 02:36
　　　│└◆6485:Re[4]:enumerate環境が使えなくなりました [さとう] 09/25 00:52
　　　├◆6479:Re[3]:enumerate環境が使えなくなりました [田中徹] 09/24 03:10
　　　│└◆6486:Re[4]:enumerate環境が使えなくなりました [さとう] 09/25 01:01
　　　│　└◆6490:Re[5]:enumerate環境が使えなくなりました [田中徹] 09/25 03:45
　　　│　　└◆6494:Re[6]:enumerate環境が使えなくなりました [さとう] 09/25 13:33
　　　└◆6480:Re[3]:enumerate環境が使えなくなりました [M] 09/24 15:34
　　　　├◆6481:Re[4]:enumerate環境が使えなくなりました [tommy_minor] 09/24 17:58
　　　　│└◆6489:Re[5]:enumerate環境が使えなくなりました [さとう] 09/25 01:07
　　　　│　└◆6491:Re[6]:enumerate環境が使えなくなりました [石原　守] 09/25 08:14
　　　　│　　├◆6492:Re[7]:enumerate環境が使えなくなりました [田中徹] 09/25 10:13
　　　　│　　└◆6495:Re[7]:enumerate環境が使えなくなりました [さとう] 09/25 13:39<-last
　　　　├◆6487:Re[4]:enumerate環境が使えなくなりました [さとう] 09/25 01:03
　　　　└◆6488:Re[4]:enumerate環境が使えなくなりました [さとう] 09/25 01:05