> ところが、線分が斜めの場合、即ちx,y軸に平行でない場合は
> そうならないように思われます。

それは eepic.sty の仕様のようです。
下の re6947a.tex でお確かめください。
PostScript に至っては仕様として明示してあります：

##############################################################
　　0 setlinewidth
による線の太さは，そのデバイスの最小の太さとなる。
##############################################################

> 解決法が有れば教えていただけないでしょうか。

アスタリスクつきの
    \heikoukigou* (\Heikoukigou*)
を用意することにしました。
下の re6947b.tex をタイプセットしてみて下さい。
（修正パック 071210 で実装してありますが，
　ドキュメントは近日中に Wiki に入れます(^^ゞ）

% --- re6947a.tex -----------------------------------------
\documentclass{jarticle}
\usepackage{epic,eepic}

\begin{document}
\begin{picture}(100,100)
  \allinethickness{0pt}
  \drawline(0,0)(100,10)
\end{picture}
\end{document}

% --- re6947b.tex -----------------------------------------
\documentclass{jarticle}
\usepackage{emathPh}
\usepackage{multido}

\begin{document}

\unitlength=30pt
\begin{zahyou}(-1,3)(-1,3)
\tenretu{A(1,1)sw;B(2,2)ne}
%{\setlength\allinethickness{0pt}\heikoukigou{\A\B}}
\heikoukigou*{\A\B}
\emDottedline{\A\B}
\kuromaru{\A;\B}
\end{zahyou}
\end{document}

▼関連発言
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└◆6947:heikoukigou [st] 01/12 20:27
　└◆6948:Re:heikoukigou [tDB] 01/12 21:47
　　└◆6949:Re[2]:heikoukigou [st] 01/12 22:42<-last