> ! LaTeX Error: Command \eqref already defined.

このエラーは，スタイルファイルの衝突によるものです。
スタイルファイルのロード順が問題でしょう。

> 2006年東大のプリアンブルに
> \usepackage[dvipdfmx]{hyperref}
> \usepackage{atbegshi}
> \AtBeginShipoutFirst{\special{pdf:tounicode 90ms-RKSJ-UCS2}} %SJISの場合
> \usepackage{emathLb}
> を追加して、

追加の場所が問題です。
プリアンブルを全部書いてください。
（\begin{document}まで）
（ログファイルを追いかければ，わかるとはいうものの
　そこまでやる元気はない。(^^;)

▼関連発言
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└◆8174:emathLb.sty[2008/03/09 v 0.11] [st] 06/07 22:42
　└◆8175:Re:emathLb.sty[2008/03/09 v 0.11] [tDB] 06/08 08:29
　　└◆8176:Re[2]:emathLb.sty[2008/03/09 v 0.11] [st] 06/08 15:30
　　　└◆8177:Re[3]:emathLb.sty[2008/03/09 v 0.11] [tDB] 06/08 16:08
　　　　└◆8178:Re[4]:emathLb.sty[2008/03/09 v 0.11] [st] 06/08 16:22
　　　　　└◆8179:Re[5]:emathLb.sty[2008/03/09 v 0.11] [tDB] 06/08 16:33
　　　　　　└◆8180:Re[6]:emathLb.sty[2008/03/09 v 0.11] [st] 06/08 16:43
　　　　　　　└◆8181:Re[7]:emathLb.sty[2008/03/09 v 0.11] [tDB] 06/08 17:00
　　　　　　　　└◆8183:Re[8]:emathLb.sty[2008/03/09 v 0.11] [st] 06/09 00:46
　　　　　　　　　└◆8184:Re[9]:emathLb.sty[2008/03/09 v 0.11] [tDB] 06/09 07:52
　　　　　　　　　　└◆8185:Re[10]:emathLb.sty[2008/03/09 v 0.11] [st] 06/09 14:51<-last