これは，edaenumerate環境の仕様です。

% ----------------------------------------
\documentclass{jarticle}
\usepackage{emath}

\pagestyle{plain}

\begin{document}
下の\fbox1においては，大問番号と小問番号のベースラインがずれます。
（これは，\textsf{edaenumerate}環境の仕様です）

これを避けたい場合は，\textsf{edaenumerate}環境の先頭行に登場する
分数などに\verb+\smash+をかぶせます($---> \fbox2$)。

\begin{enumerate}[\protect\expandafter\fbox 1]
\item 
  \begin{edaenumerate}[(1)]
    \item $x-2=5$
    \item $\bunsuu12x-2=5$
  \end{edaenumerate}

\item 
  \begin{edaenumerate}[(1)]
    \item $x-2=5$
    \item $\smash{\bunsuu12}x-2=5$
  \end{edaenumerate}
\end{enumerate}
\end{document}

▼関連発言
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└◆2472:解答部のedaenumerate [マッカマン] 01/16 15:29
　└◆2474:Re:解答部のedaenumerate [tDB] 01/16 15:47
　　└◆2477:Re[2]:解答部のedaenumerate [マッカマン] 01/16 17:38
　　　└◆2480:Re[3]:解答部のedaenumerate [tDB] 01/16 22:12
　　　　└◆2483:Re[4]:解答部のedaenumerate [マッカマン] 01/16 23:38<-last