既に２通りの方法が示されていますが，
私の方法も書かせていただきます。

ご質問の前提がはっきりしない
  1) emathPh.sty で \Gurafu or \yGurafu
  2) emathPp.sty で \YGurafu(*)
  3) emathPs.sty で
いずれなのか ？

以下，(2)としての話です。

切り出したい部分のみを zahyou環境で記述し，
全体の座標環境に取り込む

という方法です。

% ----------------------
\documentclass{jarticle}
\usepackage{emathPp}
\begin{document}
\begin{zahyou}[ul=10mm](-1,4)(-1,12)
  \def\Fx{2*X*X}
  \tenretu*{A(2,9);B(3,9);C(3,11);D(2,11)}
  \Put\C[syaei=xy]{}
  \Put\B[syaei=y]{}
  \Put\D[syaei=x]{}
% \YGurafu*\Fx
  \Put\A{%
    \begin{zahyou*}(2,3)(9,11)
      \Thicklines
      \YGurafu*[migix=2.5]\Fx
    \end{zahyou*}%
  }
\end{zahyou}
\end{document}

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