注を巻末にまとめるスタイルファイルに endnotes.sty があります。
私は使ったことがないのですが，試してみました。
下のリストをタイプセットすると，
　　align*環境内の注が二重に出力
されるようです。

1) 下のリストには emath は登場していません。
2) 回避法が知られているのかどうかは不明です。
3) emath では，かつて align環境内などで \Hako の番号が進んでしまう
　という現象が発生していましたがそれと同根の問題でしょう。
　hako.sty と似た方法で回避は可能ですが，
　短気を起こして，EMendnotes.sty を作ることにしました。 
% -----------------------------------------
\documentclass[fleqn]{jarticle}
\usepackage{amsmath}
\usepackage{endnotes}

\begin{document}
[解答]\\
  align の外 \endnote{aaa}
  \begin{align*}
     y &= ... \endnote{bbb}\\
       &= ... \endnote{ccc}
  \end{align*}
  外 \endnote{ddd}

[解説]
\theendnotes
\end{document}

▼関連発言
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└◆7573:参照して解説を付加できるようなコマンド [よ] 10/02 13:29
　└◆7574:Re:参照して解説を付加できるようなコマンド [tDB] 10/02 16:02
　　├◆7575:Re[2]:参照して解説を付加できるようなコマンド [よ] 10/02 16:36
　　├◆7579:endnotes.sty [tDB] 10/03 08:25
　　└◆7580:EMendnotes.sty [tDB] 10/03 08:32
　　　└◆7581:Re:EMendnotes.sty [よ] 10/03 14:40<-last