一部だけ気がついたことを書き込みます。

> \begin{mawarikomi} に関しては、改行の直後に指定すると、
> 「段落中に〜」というメッセージがでます。
> 改行を２つ入れると（空白行を1行はさむと）警告がでないようですが、
> これは何か違いがあるのでしょうか。
改行2回で段落があらたまるのがTeXの仕様です。
1回では段落があらたまらない（同一段落になる）ので
警告が出るわけです。

> 問題なければ、（文中はだめとだとしても）改行の直後であれば、
> エラーがでないようにできないでしょうか。
個人用に必ず段落をあらためるように改造してみるのも
一つの方法かと思います。

▼関連発言
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└◆7741:回り込みについて [なす] 12/10 18:34
　└◆7747:Re:回り込みについて [石原　守] 12/11 12:40
　　└◆7748:Re[2]:回り込みについて [なす] 12/11 17:05<-last