早速のご返信ありがとうございます。

> これは，platex の起動に
>     -shell-escape オプション
> がついていないことを表しています。
これについては、texshopの設定の問題ですね？
小川先生のページなど参考に、もう一度調べてみます。

> 実行したフォルダに ex1.tex が存在していますか？
はい。cdコマンドで、
/Users/ユーザ名/texmf/doc/emathPp
フォルダに移動し、
/Applications/pTeX.app/teTeX/bin/platex -shell-escape ex1.tex
としています。この際、同フォルダ内に生成されるex1.logを開くと、中身は空です。

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