解決しました。

１）emath.plの場所について
/Library/Perl
ではダメで、
/Library/Perl/5.10.0
でした。

２）--shell-escapeについて
http://www2.kumagaku.ac.jp/teacher/herogw/shell.html
にありました。

なお、既存のtexファイルのタイプセットすらできなくなった問題についても、
pTeX.appの再インストールで解決しました。

ありがとうございました。

▼関連発言
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└◆8976:perlが正しく実行されません [木村] 07/08 13:25
　├◆8981:Re:perlが正しく実行されません [tDB] 07/08 14:00
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　└◆8988:Re:perlが正しく実行されません [木村] 07/09 22:06<-last