emgather には，いくつか問題があるので，
今回のemath訂正版から外しています。
旧版から持ってきて，下のリストあたりが妥協点かなと思います。

  \documentclass[a4j,fleqn]{jarticle}
  \usepackage[dvipdfmx]{hyperref}
  \usepackage[notMy]{emath}
%  \usepackage{emathOtf}% あってもなくても動作には影響なし
  \usepackage{emequation}
  
  \begin{document}
  
  \begin{emgather}
  1+1=2 \notag\\
  1 \times 1=1 \EMlabel{sikii}
  \end{emgather}
  
  \EMeqref{sikii}において．．．．．  
  \end{document}

▼関連発言
│
└◆1442:hyperrefと\atagを使用 [st] 01/20 12:45
　└◆1443:Re:hyperrefと\atagを使用 [tDB] 01/20 16:49
　　├◆1444:--- [---] 01/21 11:55
　　├◆1445:Re[2]:hyperrefと\atagを使用 [st] 01/21 12:01
　　└◆1446:hyperrefと\eqlabelを使用 [st] 01/21 12:44
　　　├◆1447:--- [---] 01/21 13:53
　　　└◆1448:Re:hyperrefと\eqlabelを使用 [tDB] 01/21 16:50
　　　　└◆1449:Re[2]:hyperrefと\eqlabelを使用 [st] 01/22 13:03<-last