> \[ 1+1=2 \eqlabel{sikii} \]
これは syntax error ですね。
数式番号を付与しないことを前提とする環境
  \[ ... \] 
内では，ラベル付与はできません。
（これは hyperref, emath の制約ではなく，LaTeX の仕様です。）

替えて equation環境を用います。

^^^^^ 実は，emath では \[ ... \] 内に \eqlabel を配置しても通るんですよね。
　　　まあ，お行儀悪いですから，やらんほうがよいでしょう。


\documentclass[a4j,fleqn]{jarticle}
\usepackage[dvipdfmx]{hyperref}
\usepackage[notMy]{emath}
\usepackage{emathLb}

\begin{document}
\begin{equation}
 1+1=2 \eqlabel{sikii}
\end{equation}

\eqref{sikii}
\end{document}

▼関連発言
│
└◆1442:hyperrefと\atagを使用 [st] 01/20 12:45
　└◆1443:Re:hyperrefと\atagを使用 [tDB] 01/20 16:49
　　├◆1444:--- [---] 01/21 11:55
　　├◆1445:Re[2]:hyperrefと\atagを使用 [st] 01/21 12:01
　　└◆1446:hyperrefと\eqlabelを使用 [st] 01/21 12:44
　　　├◆1447:--- [---] 01/21 13:53
　　　└◆1448:Re:hyperrefと\eqlabelを使用 [tDB] 01/21 16:50
　　　　└◆1449:Re[2]:hyperrefと\eqlabelを使用 [st] 01/22 13:03<-last