参考になるかどうかはわかりませんが…

\usepackage{amsmath,amssymb,multicol,arydshle,arhako,cases}
を
\usepackage{amsmath,amssymb,multicol,arhako,cases}

としてコンパイルすると、私の環境ではy軸はずれませんでした。

#arydshle.styがどういうものかは存じません。
#arydshle.styは私はもっていませんでした。

▼関連発言
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└◆2152:グラフのy軸がずれる [任廿郎] 11/28 11:10
　├◆2154:Re:グラフのy軸がずれる [Natumi] 11/28 12:32
　│└◆2161:Re[2]:グラフのy軸がずれる [任廿郎] 11/28 14:48
　├◆2155:Re:グラフのy軸がずれる [tDB] 11/28 12:47
　│└◆2162:Re[2]:グラフのy軸がずれる [任廿郎] 11/28 14:51
　│　└◆2163:Re[3]:グラフのy軸がずれる [tDB] 11/28 15:33
　│　　└◆2164:Re[4]:グラフのy軸がずれる（解決＆お詫び） [任廿郎] 11/28 15:47<-last
　└◆2156:Re:グラフのy軸がずれる [Hiro] 11/28 13:16
　　└◆2157:arydshle.sty [tDB] 11/28 13:35
　　　└◆2160:　　補足 [tDB] 11/28 14:22