> 波線を amidakuzi と一緒に使い使いたいと思いましたが，
> yscale が1以外のときはうまくいきません．
> 修正のほど，よろしくお願いいたします．

\namisen が emathPxy 対応になっていませんね。
修正しましたが，
    emathPh.sty
    emathPxy.sty
    emathPp.sty
にまたがります。三者をまとめた書庫ファイルを「実験版」ページにおきました。

> 参考サイト：http://www.math.nagoya-u.ac.jp/~kanai/2001kisoIV/ch4.pdf

これでみると，
    \namisen
よりは，bezier曲線を用いた
    \Drawtpic
の方が適当かなと思いましたが，どんなものでしょう。
一例を下に書きます。
なお，\Drawtpic については，簡単な説明が sampleP.pdf (.tex) にあります。
そこでは，dviout でのみ使えるかのような記述がありますが，
前半は dvipsk でも通用します。

% --- re4564.tex --------------------------------------
\documentclass{jarticle}
\usepackage{emathP}
\begin{document}
\begin{zahyou*}[ul=5.mm,yscale=.5](1,3)(-5,0) 
\tenretu{[$i$]A(1,0)n;[$j$]B(2,0)n;[$\sigma(i)$]E(2.5,-5)s;[$\sigma(j)$]F(1,-5)s}
\kuromaru{\A;\B;\E;\F}
\Drawtpic{\A(1.1,-1.5)(2.4,-3.5)\E}
\end{zahyou*}
\end{document}

▼関連発言
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└◆4564:\namisen を 任意の yscale で [TaD] 04/16 00:29
　├◆4565:Re:\namisen を 任意の yscale で [TaD] 04/16 02:30
　│├◆4566:Re[2]:\namisen を 任意の yscale で [石原　守] 04/16 06:42
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　│　└◆4575:Re[3]:\namisen を 任意の yscale で [tDB] 04/16 17:31
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　　└◆4574:\Drawtpic [tDB] 04/16 17:11
　　　└◆4576:Re:\Drawtpic（感謝） [TaD] 04/16 18:14<-last