【原因】
お示しのリストの 67行目でしょうか（＊）
> \text{\eqref{Ed-2}より \kaku{B}=\kaku{Q}なので、 } \notag \\
が原因です。
align環境ですから，`&'で桁揃えをしますが，
この行には`&'がありませんから，桁揃えの位置がこの行分，右にずれます。

【対策】
\text ではなく，\intertext にすればよいのでは？

【注】
（＊）\documentclass... を1行目として数えています。
　　　1行80charを超える行がありますから，
　　　エディタによっては行数表示がずれるかもしれません。

【独白】
＃　本来，別行立て数式は，版面横幅全部を前提とする環境であって，
＃　mawarikomi などと併用するチマチマした使用とは相容れないものと思います。

▼関連発言
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└◆4025:--- [---] 11/28 07:38
　└◆4026:Re:---mawarikomi環境下のalign環境で数式を左寄せするには？ [zyam56] 11/28 07:59
　　├◆4027:Re[2]:---mawarikomi環境下のalign環境で数式を左寄せするに.. [tDB] 11/28 08:36
　　│└◆4029:Re[3]:---mawarikomi環境下のalign環境で数式を左寄せする.. [zyam56] 11/28 17:38
　　│　└◆4030:Re[4]:---mawarikomi環境下のalign環境で数式を左寄せす.. [tDB] 11/28 17:40
　　│　　└◆4036:Re[5]:---mawarikomi環境下のalign環境で数式を左寄せ.. [tDB] 11/29 11:36
　　├◆4031:Re[2]:---mawarikomi環境下のalign環境で数式を左寄せするに.. [zyam56] 11/28 19:09
　　├◆4032:mawarikomi 環境のテキスト部に別行立て数式 [tDB] 11/29 11:04
　　├◆4033:別行立て数式は右へ右へ．．．．． [tDB] 11/29 11:13
　　├◆4034:mawarikomi環境下のalign [tDB] 11/29 11:19
　　└◆4035:mawarikomi & \intertext [tDB] 11/29 11:32
　　　├◆4037:Re:mawarikomi & \intertext [zyam56] 11/29 12:39
　　　└◆4038:emathMw.sty v0.14 \MWintertext 新設 [tDB] 11/30 11:05<-last